远近配穴是指以病变部位的局部和远端穴位配合应用。本法在应用时，局部多位于头部、胸腹及背腰等躯干部，远部多位于四肢肘膝以下部位。如外感头痛取太阳、列缺等；目疾取睛明、合谷等；寒邪犯胃引起的胃痛取中脘、梁丘等。
远近配穴法是标本根结理论的具体应用，为历代医家所重视，如《灵枢·四时气》：“腹中肠鸣，气上冲胸，喘不能久立，邪在大肠，刺肓之原、巨虚上廉、三里。”又《百症赋》：“项强多恶风，束骨相连于天柱。”再如《席弘赋》：“睛明治眼未效时，合谷光明安可缺。”
